Logowanie
Zarejestruj się
Zresetuj hasło
Publikuj i Dystrybuuj
Rozwiązania Wydawnicze
Rozwiązania Dystrybucyjne
Dziedziny
Architektura i projektowanie
Bibliotekoznawstwo i bibliologia
Biznes i ekonomia
Chemia
Chemia przemysłowa
Filozofia
Fizyka
Historia
Informatyka
Inżynieria
Inżynieria materiałowa
Językoznawstwo i semiotyka
Kulturoznawstwo
Literatura
Matematyka
Medycyna
Muzyka
Nauki farmaceutyczne
Nauki klasyczne i starożytne studia bliskowschodnie
Nauki o Ziemi
Nauki o organizmach żywych
Nauki społeczne
Prawo
Sport i rekreacja
Studia judaistyczne
Sztuka
Teologia i religia
Zagadnienia ogólne
Publikacje
Czasopisma
Książki
Materiały konferencyjne
Wydawcy
Blog
Kontakt
Wyszukiwanie
EUR
USD
GBP
Polski
English
Deutsch
Polski
Español
Français
Italiano
Koszyk
Home
Czasopisma
Polish Journal of Microbiology
Tom 70 (2021): Zeszyt 3 (September 2021)
Otwarty dostęp
Transcriptome Analysis of
Komagataeibacter europaeus
CGMCC 20445 Responses to Different Acidity Levels During Acetic Acid Fermentation
LITING WANG
LITING WANG
,
HOUSHENG HONG
HOUSHENG HONG
,
CHENGBO ZHANG
CHENGBO ZHANG
,
ZUNXI HUANG
ZUNXI HUANG
oraz
HUIMING GUO
HUIMING GUO
| 17 wrz 2021
Polish Journal of Microbiology
Tom 70 (2021): Zeszyt 3 (September 2021)
O artykule
Poprzedni artykuł
Następny artykuł
Abstrakt
Artykuł
Ilustracje i tabele
Referencje
Autorzy
Artykuły w tym zeszycie
Podgląd
PDF
Zacytuj
Udostępnij
Article Category:
original-paper
Data publikacji:
17 wrz 2021
Zakres stron:
305 - 313
Otrzymano:
09 mar 2021
Przyjęty:
20 cze 2021
DOI:
https://doi.org/10.33073/pjm-2021-027
Słowa kluczowe
acetic acid bacteria
,
acid resistance
,
transcriptomics
© 2021 Liting Wang et al., published by Sciendo
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
Fig. 1.
Acetic acid fermentation of Komagataeibacter europaeus CGMCC 20445 at an initial ethanol concentration of 4.3% (v/v).A) The cell growth of K. europaeus CGMCC 20445. B) Changes in the acidity of the fermentation medium. The arrow indicates the sample corresponding to the transcriptome sequencing. Data obtained from three biological replicates were shown as mean ± standard deviation.
Fig. 2.
Heatmap of differentially expressed genes. The values of lg (FPKM+1) of genes in different samples are normalized, and the genes are clustered. The upregulated and downregulated genes were represented by red and blue grids, respectively. Table S3 shows the names of each gene, fkpm, padj, and the annotation information.
Fig. 3.
The expression status of genes associated with acid resistance for K. europaeus CGMCC 20445 (acidity: 4.08 ± 0.21 g/100 ml). The upregulated and downregulated genes were denoted by red and blue texts, respectively. PQQ-ADH – pyrroloquinoline quinone-dependent alcohol dehydrogenase; PQQ-ALDH – pyrroloquinoline quinone-dependent aldehyde dehydrogenase; NAD-ADH – NAD-dependent alcohol dehydrogenase; NAD-ALDH – NAD-dependent acetaldehyde dehydrogenase.
Statistics of differentially expressed genes of the samples treated.
Time
Number of up-regulated genes
Number of down-regulated genes differentially expressed genes
40 h
502
a
(14%)
406 (12%)
908 (26%)
64 h
500 (14%)
479 (14%)
979 (28%)
88 h
602 (17%)
620 (18%)
1,222 (35%)