<trans-abstract xml:lang="en" xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">

<p>Advancements in modern genomics driven by the continuous DNA sequencing of complete microbial genomes, including pathogenic microorganisms, have revolutionised the approach to the process of designing new generation vaccine antigens. Genomic data is the source of hypotheses about potential antigen immunogenicity, reversing the standard science research process. As a result, it is possible to analyse thousands of genes regardless of their <italic>in vivo</italic> expression levels. On this basis, we can choose the pool of protein candidates to examine further, mapping their epitopes recognised by the elements of the human immune system. The acquired information on the structure of the selected antigen and its interactions with the immune system may be used to design and synthesise new immunogenic molecules, optimising time and resources needed to introduce new vaccines to the market.</p>
</trans-abstract>

Advancements in modern genomics driven by the continuous DNA sequencing of complete microbial genomes, including pathogenic microorganisms, have revolutionised the approach to the process of designing new generation vaccine antigens. Genomic data is the source of hypotheses about potential antigen immunogenicity, reversing the standard science research process. As a result, it is possible to analyse thousands of genes regardless of their in vivo expression levels. On this basis, we can choose the pool of protein candidates to examine further, mapping their epitopes recognised by the elements of the human immune system. The acquired information on the structure of the selected antigen and its interactions with the immune system may be used to design and synthesise new immunogenic molecules, optimising time and resources needed to introduce new vaccines to the market.

Modern Methods of Identification of Protein Vaccine Antigens

Zakład Genetyki Bakterii, Instytut Mikrobiologii

Advancements of Microbiology

This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Współczesne Metody Identyfikacji Białkowych Antygenów Szczepionkowych

<abstract xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">

<p>Postępy w genomice związane z ustawicznym sekwencjonowaniem kompletnych genomów drobnoustrojów, w tym mikroorganizmów patogennych, zrewolucjonizowały podejście do wyboru i projektowania antygenów szczepionkowych nowej generacji. Odwrócono klasyczny proces badawczy, ponieważ to zbiór danych genomowych stał się źródłem hipotez o immunogenności wytypowanych antygenów. W efekcie, możliwe jest wydajne przeanalizowanie tysięcy genów, niezależnie od poziomu ich ekspresji <italic>in vivo.</italic> Na tej podstawie typuje się pulę białkowych kandydatów, które można następnie poddać dalszym badaniom i dokładnie opisać ich epitopy powierzchniowe rozpoznawane przez elementy układu odpornościowego człowieka. Informacje o strukturze wybranego antygenu i jego interakcjach z układem immunologicznym mogą posłużyć do syntezy nowych cząsteczek, optymalizując czas i środki niezbędne do wprowadzenia do użytku nowego preparatu szczepionkowego.</p>
</abstract>

Postępy w genomice związane z ustawicznym sekwencjonowaniem kompletnych genomów drobnoustrojów, w tym mikroorganizmów patogennych, zrewolucjonizowały podejście do wyboru i projektowania antygenów szczepionkowych nowej generacji. Odwrócono klasyczny proces badawczy, ponieważ to zbiór danych genomowych stał się źródłem hipotez o immunogenności wytypowanych antygenów. W efekcie, możliwe jest wydajne przeanalizowanie tysięcy genów, niezależnie od poziomu ich ekspresji in vivo. Na tej podstawie typuje się pulę białkowych kandydatów, które można następnie poddać dalszym badaniom i dokładnie opisać ich epitopy powierzchniowe rozpoznawane przez elementy układu odpornościowego człowieka. Informacje o strukturze wybranego antygenu i jego interakcjach z układem immunologicznym mogą posłużyć do syntezy nowych cząsteczek, optymalizując czas i środki niezbędne do wprowadzenia do użytku nowego preparatu szczepionkowego.

Advancements in modern genomics driven by the continuous DNA sequencing of complete microbial genomes, including pathogenic microorganisms, have revolutionised...

Modern Methods of Identification of Protein Vaccine Antigens

Data publikacji: 30 lis 2022

Zakres stron: 211 - 221

Otrzymano: 01 paź 2022

Przyjęty: 01 lis 2022

DOI: https://doi.org/10.2478/am-2022-022

Słowa kluczowe
antigen, reverse vaccinology, vaccine

© 2022 Rafał Jabłuszewski et al., published by Sciendo

This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Modern Methods of Identification of Protein Vaccine Antigens

Data publikacji: 30 lis 2022

Zakres stron: 211 - 221

Otrzymano: 01 paź 2022

Przyjęty: 01 lis 2022

DOI: https://doi.org/10.2478/am-2022-022

Słowa kluczoweantigen, reverse vaccinology, vaccine

© 2022 Rafał Jabłuszewski et al., published by Sciendo

This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Słowa kluczowe
antigen, reverse vaccinology, vaccine