Logowanie
Zarejestruj się
Zresetuj hasło
Publikuj i Dystrybuuj
Rozwiązania Wydawnicze
Rozwiązania Dystrybucyjne
Dziedziny
Architektura i projektowanie
Bibliotekoznawstwo i bibliologia
Biznes i ekonomia
Chemia
Chemia przemysłowa
Filozofia
Fizyka
Historia
Informatyka
Inżynieria
Inżynieria materiałowa
Językoznawstwo i semiotyka
Kulturoznawstwo
Literatura
Matematyka
Medycyna
Muzyka
Nauki farmaceutyczne
Nauki klasyczne i starożytne studia bliskowschodnie
Nauki o Ziemi
Nauki o organizmach żywych
Nauki społeczne
Prawo
Sport i rekreacja
Studia judaistyczne
Sztuka
Teologia i religia
Zagadnienia ogólne
Publikacje
Czasopisma
Książki
Materiały konferencyjne
Wydawcy
Blog
Kontakt
Wyszukiwanie
EUR
USD
GBP
Polski
English
Deutsch
Polski
Español
Français
Italiano
Koszyk
Home
Czasopisma
Acta Medica Martiniana
Tom 24 (2024): Zeszyt 1 (April 2024)
Otwarty dostęp
Optimizing Droplet Digital PCR Assay for Precise Assessment of MEIS1 Gene Promoter Methylation
Samec Marek
Samec Marek
,
Baranova Ivana
Baranova Ivana
,
Zavhorodnia Iryna
Zavhorodnia Iryna
,
Pec Martin
Pec Martin
,
Pecova Renata
Pecova Renata
oraz
Lucansky Vincent
Lucansky Vincent
| 27 kwi 2024
Acta Medica Martiniana
Tom 24 (2024): Zeszyt 1 (April 2024)
O artykule
Poprzedni artykuł
Następny artykuł
Abstrakt
Artykuł
Ilustracje i tabele
Referencje
Autorzy
Artykuły w tym zeszycie
Podgląd
PDF
Zacytuj
Udostępnij
Data publikacji:
27 kwi 2024
Zakres stron:
21 - 28
Otrzymano:
19 lut 2024
Przyjęty:
11 mar 2024
DOI:
https://doi.org/10.2478/acm-2024-0004
Słowa kluczowe
methylation
,
ddPCR
,
primer design
© 2024 Samec Marek et al., published by Sciendo
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.
Fig. 1
Promoter region of MEIS1 with marked TSS
Fig. 2
CpG island prediction generated by MethPrimer software
Fig. 3
PCR optimization. Figure 3A shows a positive signal generated by methylated probes using methylated control DNA (column B01); Figure 3B shows a positive signal generated by unmethylated probes using unmethylated control DNA (column B04). The positive signal generated by unmethylated probes in line B02 demonstrates the cross-reactivity of unmethylated probes with methylated control DNA.
Fig. 4
Concentration gradient: A) methylated DNA control using the methylated probe. B) unmethylated DNA control using the unmethylated probe.
Primer and probe sequences for MEIS1 detection
Primers
Name
Sequence (5´→3´)
MEIS1_1 Forward
TGGGGAGAGAGTTTGTAGG
MEIS1_1 Reverse
ACACAAACACCACACACC
Probes
Name
Sequence
MEIS1_1 Methylated probe (FAM-BHQ1)
CGGTCGCGGGTTATTGTTTGC
MEIS1_1 Unmethylated probe (HEX-IBFQ)
TGGTGGTTGTGGGTTATTGTTTGTGT