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Journal of Veterinary Research
Band 66 (2022): Heft 3 (September 2022)
Uneingeschränkter Zugang
Characterisation of ORF3, M, N and E gene sequences of porcine epidemic diarrhoea virus from domestic pigs in Poland
Monika Olech
Monika Olech
,
Marta Antas
Marta Antas
und
Anna Szczotka-Bochniarz
Anna Szczotka-Bochniarz
| 30. Sept. 2022
Journal of Veterinary Research
Band 66 (2022): Heft 3 (September 2022)
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Online veröffentlicht:
30. Sept. 2022
Seitenbereich:
317 - 324
Eingereicht:
24. Apr. 2022
Akzeptiert:
12. Sept. 2022
DOI:
https://doi.org/10.2478/jvetres-2022-0051
Schlüsselwörter
porcine epidemic diarrhoea virus
,
E gene
,
M gene
,
N gene
,
ORF3
,
phylogenetic analysis
© 2022 M. Olech et al. published by Sciendo
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 3.0 License.
Fig. 1
Phylogenetic relationship between the sequences of PEDV Polish strains and sequences of reference strains obtained from GenBank. The phylogenetic trees were constructed on the basis of the ORF3 (a) and E (b) nucleotide sequences with MEGA6 software using the neighbour-joining method. Bootstrap values >70 are shown. The numbers of each branch represent the bootstrap value calculated using 1,000 replicates. The scale bars indicate nucleotide substitutions per site. PEDV isolates identified in this study are indicated with solid black circles
Fig. 2
Phylogenetic relationship between the sequences of PEDV Polish strains and sequences of reference strains obtained from GenBank. The phylogenetic trees were constructed on the basis of the M (a) and N (b) nucleotide sequences with the MEGA6 software using the neighbour-joining method. Bootstrap values >70 are shown. The numbers of each branch represent the bootstrap value calculated using 1,000 replicates. The scale bars indicate nucleotide substitutions per site. PEDV isolates identified in this study are indicated with solid black circles