Logowanie
Zarejestruj się
Zresetuj hasło
Publikuj i Dystrybuuj
Rozwiązania Wydawnicze
Rozwiązania Dystrybucyjne
Dziedziny
Architektura i projektowanie
Bibliotekoznawstwo i bibliologia
Biznes i ekonomia
Chemia
Chemia przemysłowa
Filozofia
Fizyka
Historia
Informatyka
Inżynieria
Inżynieria materiałowa
Językoznawstwo i semiotyka
Kulturoznawstwo
Literatura
Matematyka
Medycyna
Muzyka
Nauki farmaceutyczne
Nauki klasyczne i starożytne studia bliskowschodnie
Nauki o Ziemi
Nauki o organizmach żywych
Nauki społeczne
Prawo
Sport i rekreacja
Studia judaistyczne
Sztuka
Teologia i religia
Zagadnienia ogólne
Publikacje
Czasopisma
Książki
Materiały konferencyjne
Wydawcy
Blog
Kontakt
Wyszukiwanie
EUR
USD
GBP
Polski
English
Deutsch
Polski
Español
Français
Italiano
Koszyk
Home
Czasopisma
Asian Biomedicine
Tom 9 (2015): Zeszyt 1 (February 2015)
Otwarty dostęp
Pyrosequencing analysis of
KRAS
codon 61 mutations in Thai patients with advanced colorectal cancer
Chinachote Teerapakpinyo
Chinachote Teerapakpinyo
,
Phanni Wanthong
Phanni Wanthong
,
Mathawee Aumchaaumchaya
Mathawee Aumchaaumchaya
,
Piyamai Chankate
Piyamai Chankate
,
Warisa Kaikeaw
Warisa Kaikeaw
,
Warunya Tosakorn
Warunya Tosakorn
oraz
Shanop Shaungshoti
Shanop Shaungshoti
| 31 sty 2017
Asian Biomedicine
Tom 9 (2015): Zeszyt 1 (February 2015)
O artykule
Poprzedni artykuł
Następny artykuł
Abstrakt
Artykuł
Ilustracje i tabele
Referencje
Autorzy
Artykuły w tym zeszycie
Podgląd
PDF
Zacytuj
Udostępnij
Article Category:
Brief communication (Original)
Data publikacji:
31 sty 2017
Zakres stron:
61 - 67
DOI:
https://doi.org/10.5372/1905-7415.0901.369
Słowa kluczowe
Colorectal cancer
,
KRAS
,
mutation
,
pyrosequencing
,
targeted therapy
© 2017 Chinachote Teerapakpinyo, Phanni Wanthong, Mathawee Aumchaaumchaya, Piyamai Chankate, Warisa Kaikeaw, Warunya Tosakorn, Shanop Shaungshoti
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 3.0 License.
Figure 1
PCR amplification of exon 3 (codon 61) in KRAS. Codon 61 (CAA, nucleotides 181–183), which resides in exon 3 of KRAS (Transcript ID: ENST00000311936; Ensembl database) is shown in the square box. Mutations in nucleotides 182 and 183 (yellow highlighted nucleotide) reportedly result in amino acid changes including c.182A>T (p.Q61L), c.182A>G (p.Q61R), c.182A>C (p.Q61P), c.183A>C (p.Q61H), and c.183A>T (p.Q61H) in the Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer (COSMIC) database, version 63 release. Nucleotides 182 and 183 in codon 61 were sequenced in the reverse direction using KRAS61-PySeq1 and KRAS61-PySeq2 primers. A: KRAS61-Pyseq1 (5′-CTGGTCCCTCATTGCACTGTACTC-3′) and B: KRAS61-Pyseq2 (5′-GTCCCTCATTGCACTGTACTCCTCT-3′) primers complementary to red underlined nucleotides were used for pyrosequencing.
Figure 2
Histograms for KRAS codon61 wild-type and mutant discriminations. Histograms (A–G) were generated by PyroMark Q96 software using dispensation order and sequence to analyze as follows; (A–C) 5′-GCTCGATC GA-3′ and 5′-CTC[T/G/A]TGACCTGATGT-3′, (D–G) 5′-TACGTACTGC-3′ and 5′-[T/A/C/G]GACCTGCTG TG-3′, respectively.
Figure 3
Pyrograms showing mutations in KRAS codon 61. (A) Heterozygous c.182A>T (p.Q61L); (B) heterozygous c.183A>T (p.Q61H) and (C) heterozygous c.183A>C (p.Q61H) in samples from Thai patients with advanced colorectal cancer. The red arrows indicate mutant peak and the percentage of mutant allele in the amplified PCR products. wt: wild type; mut: mutant