Effects Of Herbicides And Fungicides On The Soil Chitinolytic Activity. A Molecular Docking Approach
Data publikacji: 05 paź 2015
Zakres stron: 439 - 450
DOI: https://doi.org/10.1515/eces-2015-0025
Słowa kluczowe
© Diana Larisa Vlădoiu et al.
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 3.0 License.
W celu oceny oddziaływań chitynaz bakteryjnych należących do rodziny GH18 i GH19 z dwoma herbicydami (chlorosulfuron i nikosulfuron) i dwoma fungicydami (difenokonazol i drazoxolon) przeprowadzono badania dokowania molekularnego za pomocą programów SwissDock i PatchDock. Oba programy dokowania molekularnego przewidują, że wszystkie badane pestycydy wiążą się z miejscami aktywnymi chitynaz, wytwarzanych przez drobnoustroje glebowe. Istnieją korelacje dla przewidywanych wartości energii wiązania kompleksów receptor-ligand uzyskanych za pomocą dwóch programów, potwierdzając przewidywane interakcje między chitynazami a pestycydami. Oddziaływania chitynaz z pestycydami dotyczą tych samych reszt, jak ich interakcje ze znanymi inhibitorami, co sugeruje hamujące zdolności pestycydów. Pestycydy oddziałują silniej z chitynazami należącymi do rodziny GH18 - ich miejsca aktywne wykazują wyższą polarność niż te z chitynaz GH19. Ponadto, herbicydy wykazują wyższe zdolności hamujące wobec chitynaz bakteryjnych w porównaniu do fungicydów.