Accesso libero

The Human Gastrointestinal Tract Microbiome – Selected Data

Beata Tokarz-Deptuła
Beata Tokarz-Deptuła
, 
Paulina Dudziak
Paulina Dudziak
, 
Natalia Gurgacz
Natalia Gurgacz
 e 
Wiesław Deptuła
Wiesław Deptuła
   | 30 nov 2022
Advancements of Microbiology's Cover Image
INFORMAZIONI SU QUESTO ARTICOLO
Articolo precedente
Articolo Successivo
Cita
Pubblicato online: 30 nov 2022
Pagine: 223 - 233
Ricevuto: 01 ott 2022
Accettato: 01 nov 2022
DOI: https://doi.org/10.2478/am-2022-023
Parole chiave
© 2022 Beata Tokarz-Deptuła et al., published by Sciendo
This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Bakterie, archeony i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w żołądku

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Firmicutes, Bacteroidota, Proteobacteria, Actinobacteria, Fusobacteria.Rodzina: Enterobacteriaceae.Rodzaj: Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus, Bacteroides, Veillonella, Corynebacterium, Clostridium, Neisseria, Stomatococcus, Prevotella, Rothia, Haemophilus, Atopobium, Porphyromonas, Gamella, Helicobacter, Propionibacterium, Fusobacterium, Achromobacter, Rhodococcus, Micrococcus, Bacillus, Actinobacillus.Gatunek: Helicobacter pylori, Campylobacter pyloridis, Fusobacterium nucleatum, Lactobacillus (L.) lactis, L. brevis, L. johnsonii. [17, 45, 71, 84, 87, 94, 119, 120]
Archeony Gatunek: Methanobrevibacter smithii. [43]
Wirusy Brak danych.
Grzyby Gromada: Ascomycota, Basidiomycota,Klasa: Saccharomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Agaricomycetes, Tremellomycetes.Rodzina: Aspergillaceae, Chaetomiaceale, Pleosporaceae, Trimorphomycetaceae.Rodzaj: Candida, Phialemonium, Alternaria, Thermomyces, Saitozyma.Gatunek: Candida albicans, Aspergillus montevidensis, Penicillium arenicola. [45, 119, 120]

Bakterie, archeony, wirusy i grzyby, reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jamie ustnej

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Firmicutes (obecnie Bacillota), Fusobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidota, Chlamydiae, Chloroflexi, Spirochaetes, Synergistetes, Saccharibacteria, Gracilibacteria.Rodzina: Staphylococcaceae, Propionibacteriaceae, Burkholderiaceae, Neisseriaceae, Fusobacteriaceae.Gatunek: Streptococcus (S) sanguinis, S. mutans, S. oralis, Veillonella sp., Granulicatella sp., Gamella sp., Actinomyces sp., Corynebacterium sp., Fusobacterium sp., Porphyromonas sp., Prevotella sp., Capnocytophaga sp., Haemophilus sp., Treponema sp., Lactobacterium sp., Eikenella sp., Leptotrichia sp., Peptostreptococcus sp., Staphylococcus sp., Eubacteria sp., Pseudoramibacter sp., Propionibacterium sp., Moraxella sp., Campylobacter sp., Desulfobacter sp., Desulfovibrio sp., Fusobacterium sp., Selemonas sp., Simonsiella sp., Wolinella sp., Neisseria perflava, Rothia mucilaginosa. [14, 23, 38, 46, 53, 72, 84, 86, 92, 117]
Archeony Rząd: Thermoplasmatales.Gatunek: Methanobrevibacter (Mbb.) sp., w tym: Mbb. oralis, Mbb. smithii, Methanobacterium sp., Methanosarcina sp., Methanosphaera sp., Candidatus Nitrososphaera evargladensis, Methanomassilicoccus luminyensis. [8, 26, 49, 118]
Wirusy Rząd: Caudovirales.Rodzina: Herpesviridae, Papillomaviridae, Anelloviridae, Siphoviridae, Myoviridae.Gatunek: bakteriofagi dla bakterii z rodzaju Streptococcus, Veillonella, Escherichia, Bulkholderia, Salmonella, Megasphaer, Roseolovirus oraz wirusy: Human cytomegalovirus, Herpes simplex virus, Coxsackievirus A5, Enterovirus A, wirus Epstein-Barr. [45, 47, 74, 88, 92, 118]
Grzyby Rząd: Saccharomycetales.Rodzaj: Candida, Cladosporium, Aureobasidium, Aspergillus, Fusarium, Cryptococcus, Alternaria, Malassezia.Gatunek: Candida albicans. [1, 6, 14, 23, 45, 80, 118]

Bakterie, archeony, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jelicie grubym

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Bacteroidota, Fiumicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Verrucomicrobia.Rodzina: Enterobacteriaceae, Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, Lachnospiraceae, Ruminococcaceae.Rodzaj: Bacteroides, Enterococcus, Eubacterium, Clostridium, Peptostreptococcus, Streptococcus, Bifidobacterium, Fusobacterium, Lactobacillus, Prevotella, Ruminococcus, Akkermansia, Roseburia, Butyrivibrio, Lachnospira, Faecalibacterium. [1, 17, 45, 46, 91, 94, 103]
Archeony Gromada: Crenarchaeota, Traumarcheota.Gatunek: Methanobrevibacter (M.) smithii. M. stadtmanae, M. luminyensis, Halorubrum (H.) koreense, H. alimentarium, H. saccharovorum, Halococcus morrhuae, Halopherax massiliense, Methanomassiliicoccales sp., Nitrosphaera sp., Sulfobolus sp. [26, 76, 94, 113]
Wirusy Rząd: Caudovirales.Rodzina: Podoviridae, Picornaviridae, Picobirnaviridae, Astroviridae, Reoviridae, Caliciviridae, Adenoviridae, Anelloviridae, Cycloviridae, Parvoviridae, Retroviridae, Pneumoviridae, Herpesviridae, Hepadnaviridae i Microviridae.Rodzaj: Enterovirus, Rotavirus, Norovirus, Papillomavirus, Polyomavirus, Mimivirus, Marseillevirus.Gatunek: bakteriofagi bakterii rodzaju Bacteroides, Firmicutes i Actinobacteria. [17, 19, 45, 76, 85, 108, 115]
Grzyby Gromada: Ascomycota, Basidiomycota, Mucoromycota.Rodzina: Cystofilobasidiaceae.Rodzaj: Saccharomyces, Malassezia, Candida, Penicillium, Cladosporium, Galactomyces, Cryptococcus, Aspergillus, Pichia, Mucor, Eurotium, Rhodotorula, Trichosporon.Gatunek: Beauveria bassiana, Lichtheimia ramosa, Clavispora lusitaniae, Galactomyces geotrichum, Isaria farinosa, Pleurostomophora richardsiae, Rhodosporidium kratochvilovae, Torulaspora delbrueckii, Yarrowia lipolytica, Aspergillus clavatus, Alternalia brassicola, Saccharomyces cerevisiae, Geotrichum sp., Cystofilobasidium sp. [16, 17, 45, 52, 76, 80, 109]

Enterotypy jelita grubego [20, 51, 87]

Dominujące rodzaje bakterii Dieta
Enterotyp 1 Bacteroides Dieta typu bogata w tłuszcze zwierzęce i białko
Enterotyp 2 Prevotella Dieta wysokobłonnikowa (roślinna)
Enterotyp 3 Ruminococcus Dieta bogata w skrobię

Bakterie, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w gardle

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Bacteroidota, Proteobacteria, Firmicutes, Actinobacteria i Fusobacteria.Rodzaj: Staphylococcus. Prevotella, Capnocytophaga, Campylobacter, Veillonella, Streptococcus, Neisseria oraz Haemophilus.Gatunek: Streptococcus viridans, Branhamella catarrhalis, Neisseria sp., Haemophilus sp. [35, 38, 72]
Archeony Brak danych.
Wirusy Gatunek: Koronawirusy, adenowirusy, pikornawirusy, wirus RSV, wirus grypy A, bakteriofagi. [31]
Grzyby Rodzaj: Candida. [34]

Bakterie, archeony, grzyby i wirusy reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w przełyku

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Firmicutes, Bacteroidota, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacteria.Rodzaj: Streptococcus, Veillonella, Prevotella, Haemophilus, Neisseria, Granulicatella i Fusobacterium.Gatunek: Streptococcus viridans, Streptococcus faecalis, Haemophilus influenzae, Neisseria catarrhalis, Klebsiella pneumonia. [27, 45, 69, 77, 89]
Archeony Rodzaj: Halobacteria, Methanosarcina. [27]
Wirusy Rodzina: Herpesviridae (Betaherpesvirus, Gammaherpesvirus), Papillomaviridae, Gammapapillomavirus).Gatunek: bakteriofagi rodzaju Streptococcus, Campylobacter, Lactococcus i γ-Proteobacterii. [27]
Grzyby Gatunek: Candida (C.) albicans, C. glabrata, Saccharomyces cerevisiae. [27]

Bakterie, wirusy i grzyby reprezentujące różne grupy systematyczne występujące w jelicie cienkim

Populacje mikroorganizmów Piśmiennictwo
Bakterie Gromada: Firmicutes, Proteobacteria, Verrucomicrobia, Bacterioidota, Actinobacteria.Rodzina: Enterobacteriaceae, Lactobacillaceae.Rodzaj: Fusobacterium, Enterococcus, Klebsiella, Bacteroides, Ruminococcus, Streptococcus, Lactobacillus, Staphylococcus, Bifidobacterium, Veillonella, Porphyromonas, Prevotella, Clostridium, Corynebacterium, Providencia, Pseudomonas, Actinomyces, Atopobium, Gemella, Granulicatella, Haemophilus, Leptotrichia, Megasphaera, Neisseria, Porphyromonas, Paraprevotellaceae, Escherichia, Rothia, Citrobacter, Lachnoclostridium, Actinobacillus, Parascardovia, Oribacterium, Granulicatella, Campylobacter, Ralstonia.Gatunek: Escherichia coli, Neisseria cinerea, Prevotella (P.) melaninogenica, P. jejuni, P. veroralis, P. aurantiaca, Haemophilus parahaemolyticus, Porphyromonas pasteri, Porphyromonas endodontalis, Fusobacterium nucleatum, Moglibacterium neglectum, Alloprevotella tannerae, Filifactor alocis, Morococcus cerebrosus, Veillonella montpellierensis, Streptobacillus hongkongensis, Clostridium leptum. [11, 17, 21, 45, 57, 64, 75, 94, 99, 101, 105, 106, 107]
Archeony Brak danych.
Wirusy Rodzaj: Rotavirus, Calicivirus, Coronavirus, Adenovirus. [9]
Grzyby Rodzaj: Candida, Saccharomyces. [45]
eISSN:
2545-3149
Lingue:
Inglese, Polacco
Frequenza di pubblicazione:
4 volte all'anno
Argomenti della rivista:
Life Sciences, Microbiology and Virology
Feed RSS della rivista