<trans-abstract xml:lang="hr" xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">

<p>Izloženost ionizirajućem zračenju čak i pri niskim razinama može pridonijeti nastanku oštećenja oka. Međutim, osnovni molekulski mehanizmi i dalje nisu potpuno razjašnjeni. Cilj našega istraživanja bio je ispuniti tu nedostajuću kariku primjenom sveobuhvatnog <italic>in silico</italic> pristupa problemu. U tu svrhu, pomoću genomskih baza podataka, portala i poslužitelja (Comparative Toxicogenomics Database, ToppGene Suite portal, Cytoscape, GeneMANIA i Metascape), identificirano je šest ključnih regulacijskih gena koji su povezani s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem (<italic>ATM</italic>, <italic>CRYAB</italic>, <italic>SIRT1</italic>, <italic>TGFB1</italic>, <italic>TREX1</italic> i <italic>YAP1</italic>) i koji su svi bili u fizičkoj interakciji. Neke od identificiranih molekulskih funkcija odnosile su se na mehanizme popravka oštećenja DNA, a druge su bile uključene u vezanje proteina, enzimsku aktivnost, metaboličke procese i posttranslacijske modifikacije proteina. Biološki procesi uglavnom su bili povezani s odgovorom na oštećenje DNA, pogotovo sa signalnim putem p53. Uočena je i značajna uloga nekoliko miRNA, poput hsa-miR-183 i hsa-miR-589, u mehanizmima povezanima s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem. Osim toga, u ovom je istraživanju opisana korisna metoda za ispitivanje štetnih učinaka izloženosti zračenju.</p>
</trans-abstract>

Izloženost ionizirajućem zračenju čak i pri niskim razinama može pridonijeti nastanku oštećenja oka. Međutim, osnovni molekulski mehanizmi i dalje nisu potpuno razjašnjeni. Cilj našega istraživanja bio je ispuniti tu nedostajuću kariku primjenom sveobuhvatnog in silico pristupa problemu. U tu svrhu, pomoću genomskih baza podataka, portala i poslužitelja (Comparative Toxicogenomics Database, ToppGene Suite portal, Cytoscape, GeneMANIA i Metascape), identificirano je šest ključnih regulacijskih gena koji su povezani s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem (ATM, CRYAB, SIRT1, TGFB1, TREX1 i YAP1) i koji su svi bili u fizičkoj interakciji. Neke od identificiranih molekulskih funkcija odnosile su se na mehanizme popravka oštećenja DNA, a druge su bile uključene u vezanje proteina, enzimsku aktivnost, metaboličke procese i posttranslacijske modifikacije proteina. Biološki procesi uglavnom su bili povezani s odgovorom na oštećenje DNA, pogotovo sa signalnim putem p53. Uočena je i značajna uloga nekoliko miRNA, poput hsa-miR-183 i hsa-miR-589, u mehanizmima povezanima s oštećenjem oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem. Osim toga, u ovom je istraživanju opisana korisna metoda za ispitivanje štetnih učinaka izloženosti zračenju.

Deciphering the molecular landscape of ionising radiation-induced eye damage with the help of genomic data mining

Faculty of Pharmacy, Department of Toxicology “Akademik Danilo Soldatović“

University of Belgrade Vinča Institute of Nuclear Sciences

Department of Radiation and Environmental Protection

Archives of Industrial Hygiene and Toxicology

This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Dekodiranje molekulskog aspekta oštećenja oka prouzročenog ionizirajućim zračenjem pomoću rudarenja genomskih podataka

Izloženost ionizirajućem zračenju čak i pri niskim razinama može pridonijeti nastanku oštećenja oka. Međutim, osnovni molekulski mehanizmi i dalje nisu potpuno...

Deciphering the molecular landscape of ionising radiation-induced eye damage with the help of genomic data mining

Article Category: Original article

Pubblicato online: 29 giu 2024

Pagine: 91 - 101

Ricevuto: 01 gen 2024

Accettato: 01 mag 2024

DOI: https://doi.org/10.2478/aiht-2024-75-3817

Parole chiave
data mining, DNA damage, miRNAs, ocular damage, radiation health effects

© 2024 Katarina Baralić et al., published by Sciendo

This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Deciphering the molecular landscape of ionising radiation-induced eye damage with the help of genomic data mining

Article Category: Original article

Pubblicato online: 29 giu 2024

Pagine: 91 - 101

Ricevuto: 01 gen 2024

Accettato: 01 mag 2024

DOI: https://doi.org/10.2478/aiht-2024-75-3817

Parole chiavedata mining, DNA damage, miRNAs, ocular damage, radiation health effects

© 2024 Katarina Baralić et al., published by Sciendo

This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License.

Parole chiave
data mining, DNA damage, miRNAs, ocular damage, radiation health effects