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Journal of Nematology
Édition 55 (2023): Edition 1 (February 2023)
Accès libre
Nematode Genome Announcement: A Draft Genome of Seed Gall Nematode,
Anguina tritici
Ashish Kumar Singh
Ashish Kumar Singh
,
Antara Das
Antara Das
,
Ila Joshi
Ila Joshi
,
Manish Kumar
Manish Kumar
,
Deshika Kohli
Deshika Kohli
,
Pankaj
Pankaj
,
Kishor Gaikwad
Kishor Gaikwad
,
Pradeep Kumar Jain
Pradeep Kumar Jain
et
Anil Sirohi
Anil Sirohi
| 15 nov. 2023
Journal of Nematology
Édition 55 (2023): Edition 1 (February 2023)
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Article Category:
Research Paper
Publié en ligne:
15 nov. 2023
Pages:
-
Reçu:
08 déc. 2022
DOI:
https://doi.org/10.2478/jofnem-2023-0031
Mots clés
earcockle
,
tundu disease
,
genome sequence
,
Illumina MiSeq
© 2023 Ashish Kumar Singh et al., published by Sciendo
This work is licensed under the Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Characteristics of A. tritici genome.
Number of contigs
843604
Assembled genome size
164398910 (164 Mb)
N50
3232
Number of gene models
39965
Median intron, bp
65
G+C %
39.1%
Gene density
26.5784
Average gene size (bp)
1347
Average CDS length (bp)
168.88
Average number of exon/genes
3.18
Average intron length (bp)
280
BUSCO
C: 36.6% [S: 35.5%, D: 1.1%], F: 14.8%, M: 48.6%, n: 982