Sprawność procesu nitryfikacji ma duże znaczenie dla efektu usuwania związków azotu ze ścieków. Problemy z prawidłowym przebiegiem nitryfikacji podczas oczyszczania ścieków pojawiają się przy skróceniu wieku osadu czynnego, niskich temperaturach ścieków w komorach napowietrzania, gwałtownych zmianach składu i ilości ścieków dopływających do oczyszczalni oraz dopływem ścieków zawierających substancje toksyczne lub inhibitujące proces utleniania azotu amonowego. Podjęto badania nad sprawdzeniem możliwości hodowli i przechowywania biomasy bakterii nitryfikacyjnych, którą można byłoby dodawać do osadu czynnego w sytuacjach spadku sprawności nitryfikacji. Przeprowadzone badania wykazały, że nawet 4-letni okres przechowywania bakterii nitryfikacyjnych nie powoduje ich zaniku.