wydzielanie soku żołądkowego i żółci – które mają efekt przeciwbakteryjny; zaburzenia wydzielania enzymów trzustkowych (np. w niewydolności zewnątrzwydzielniczej trzustki, m.in. w przebiegu mukowiscydozy), ruchy perystaltyczne jelit – zapobiegają przyleganiu bakterii do błony śluzowej jelit; naturalna odporność jelit w tym mechanizmy humoralne i komórkowe (np. niedobór sIgA, AIDS, pospolity zmienny niedobór odporności); produkcja mucyny przez komórki nabłonkowe błony śluzowej jelita hamujące bakterie chorobotwórcze, peptydy przeciwbakteryjne jelit, takie jak defensyny, zastawka krętniczo-kątnicza – zapobiegająca wstecznej translokacji bakterii z okrężnicy do jelita cienkiego | |
dieta leki modulujące florę jelitową pre i probiotyki, środki tłumiące kwas żołądkowy takie jak inhibitory pompy protonowej (PPI), Blokery H2 antybiotyki i leki zmieniające motorykę (prokinetyki, antycholinergiki i opioidy) |