<trans-abstract xml:lang="hr" xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">

COVID-19 (engl. <italic>coronavirus disease 2019</italic>) respiratorna je bolest prouzročena infekcijom SARS-CoV-2 virusom (engl. <italic>severe acute respiratory syndrome coronavirus 2</italic>). Pretpostavlja se da postoji utjecaj atmosferskih čimbenika, uključujući i onečišćenje zraka, na prenošenje koronavirusa, njegovu težinu i stopu smrtnosti. Stoga je cilj ovoga <italic>in silico</italic> istraživanja bio utvrditi odnos između ključnih onečišćivača zraka [sumporova dioksida (SO2x23), ugljikova monoksida (CO), lebdećih čestica (PM), dušikova dioksida (NO), ozona (O)] i komplikacija COVID-a 19 korištenjem: (i) komparativne toksikogenomičke baze podataka (engl. <italic>Comparative Toxicogenomic Database</italic>, CTD) za dobivanje gena, međusobno povezanih s onečišćivačima zraka i komplikacijama COVID-a 19, (ii) GeneMANIA servera za konstruiranje mreže između dobivenih i srodnih gena, (iii) ToppGene Suite za izdvajanje najvažnijih bioloških procesa/molekularnih puteva i (iv) DisGeNET baze podataka za traženje najvažnijih parova gen-bolest. Za SO2, CO, PMx, NO2 odnosno O3 utvrđena je interakcija sa 6, 6, 18, 9, odnosno 12 gena povezanih s komplikacijama COVID-a 19. Četiri su zajednička (<italic>IL10</italic>, <italic>IL6</italic>, <italic>IL1B</italic> i <italic>TNF</italic>) i u najvećem postotku (77,64 %) sudjeluju u fizičkim interakcijama. Vezivanje citokina i signalni put posredovan citokinima izdvojeni su kao najvažnija molekularna funkcija i biološki proces. Druge molekularne funkcije i biološki procesi uglavnom su bili povezani s aktivnošću citokina i upalom, što bi se moglo dovesti u vezu s citokinskom olujom i posljedičnim komplikacijama COVID-a 19. Utvrđena je veza između različitih bolesti i ispitivanih gena, posebice između <italic>CEBPA</italic> i akutne mijelogene leukemije (AML) te između <italic>TNFRSF1A</italic> i sindroma periodične vrućice povezanoga s TNF receptorom. To upozorava na moguće komplikacije u osoba zaraženih koronavirusom koje boluju od tih bolesti, poglavito kada su dodatno potaknute poremećajem funkcije spomenutih gena.
</trans-abstract>

COVID-19 (engl. coronavirus disease 2019) respiratorna je bolest prouzročena infekcijom SARS-CoV-2 virusom (engl. severe acute respiratory syndrome coronavirus 2). Pretpostavlja se da postoji utjecaj atmosferskih čimbenika, uključujući i onečišćenje zraka, na prenošenje koronavirusa, njegovu težinu i stopu smrtnosti. Stoga je cilj ovoga in silico istraživanja bio utvrditi odnos između ključnih onečišćivača zraka [sumporova dioksida (SO2x23), ugljikova monoksida (CO), lebdećih čestica (PM), dušikova dioksida (NO), ozona (O)] i komplikacija COVID-a 19 korištenjem: (i) komparativne toksikogenomičke baze podataka (engl. Comparative Toxicogenomic Database, CTD) za dobivanje gena, međusobno povezanih s onečišćivačima zraka i komplikacijama COVID-a 19, (ii) GeneMANIA servera za konstruiranje mreže između dobivenih i srodnih gena, (iii) ToppGene Suite za izdvajanje najvažnijih bioloških procesa/molekularnih puteva i (iv) DisGeNET baze podataka za traženje najvažnijih parova gen-bolest. Za SO2, CO, PMx, NO2 odnosno O3 utvrđena je interakcija sa 6, 6, 18, 9, odnosno 12 gena povezanih s komplikacijama COVID-a 19. Četiri su zajednička (IL10, IL6, IL1B i TNF) i u najvećem postotku (77,64 %) sudjeluju u fizičkim interakcijama. Vezivanje citokina i signalni put posredovan citokinima izdvojeni su kao najvažnija molekularna funkcija i biološki proces. Druge molekularne funkcije i biološki procesi uglavnom su bili povezani s aktivnošću citokina i upalom, što bi se moglo dovesti u vezu s citokinskom olujom i posljedičnim komplikacijama COVID-a 19. Utvrđena je veza između različitih bolesti i ispitivanih gena, posebice između CEBPA i akutne mijelogene leukemije (AML) te između TNFRSF1A i sindroma periodične vrućice povezanoga s TNF receptorom. To upozorava na moguće komplikacije u osoba zaraženih koronavirusom koje boluju od tih bolesti, poglavito kada su dodatno potaknute poremećajem funkcije spomenutih gena.

Joint impact of key air pollutants on COVID-19 severity: prediction based on toxicogenomic data analysis

Archives of Industrial Hygiene and Toxicology

This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.

Zajednički utjecaj ključnih onečišćivača zraka na težinu COVID-a 19 – predviđanje zasnovano na analizi toksikogenomičkih podataka

COVID-19 (engl. coronavirus disease 2019) respiratorna je bolest prouzročena infekcijom SARS-CoV-2 virusom (engl. severe acute respiratory syndrome coronavirus...

Joint impact of key air pollutants on COVID-19 severity: prediction based on toxicogenomic data analysis

Article Category: Original article

Published Online: Jul 07, 2022

Page range: 119 - 125

Received: Feb 01, 2022

Accepted: May 01, 2022

DOI: https://doi.org/10.2478/aiht-2022-73-3631

© 2022 Danijela Đukić-Ćosić, Katarina Baralić, Teodora Filipović, Dragica Božić, Katarina Živančević, Evica Antonijević Miljaković, Aleksandra Buha Đorđević, Zorica Bulat, Biljana Antonijević, and Marijana Ćurčić, published by Sciendo

This work is licensed under the Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License.